180 ورقة بحثية
من خلال تحليل الحذف متماثل الزيجوت عبر 125,730 فرداً في المكتبة الوطنية للبحوث الجينومية في المملكة المتحدة، تضع هذه الدراسة خريطة شاملة على مستوى الجينوم تعزز تشخيص الأمراض النادرة، وتكشف عن أهمية حذف المحفزات غير المشفرة، وتحدد 43 جيناً مرشحاً جديداً مرتبطاً بالأمراض.
كشفت مراجعة استعادية لبروتوكول تسلسل الجينوم الكامل الشامل في مستشفى برايمري تشيلدرنز لحديثي الولادة المصابين بعيوب القلب الخلقية أن 19.4% من المرضى كانت لديهم نتائج جينية ذات صلة سريرية، مع تلقي 10.6% منهم تشخيصاً مسبباً غالباً ما حدث قبل ظهور السمات خارج القلب، مما أتاح الإدارة الطبية في الوقت المناسب واتخاذ قرارات مدروسة من قبل الأسرة.
تدمج هذه الدراسة بيانات الجينوم، والترانسكريبتوم، وإفراز السيتوكين من 366 متبرعاً لتحديد المواقع الجينية الرئيسية، بما في ذلك CCR5-Δ32 وOAS1، التي تنظم إنتاج السيتوكين في الخلايا الوحيدة وتكشف عن الروابط المتعلقة باستقلاب الدهون ومخاطر الأمراض.
تستفيد هذه الدراسة من بيانات "يو كيه بيوبانك" (UK Biobank) وكوهورت "تراينيت إكس" (TriNetX) لتوصيف التداخل الجيني، والمسارات البيولوجية المشتركة، وأنماط المراضة المشتركة عبر أمراض المناعة الذاتية من خلال تحليل درجات المخاطر الجينية المتعددة ورسم المسارات، مما يكشف عن بنى جينية مشتركة ومتميزة تدعم مفهوم المناعة الذاتية المتعددة.
تقدم هذه الدراسة تحليلاً شاملاً لـ 392,030 جينومًا كاملاً من برنامج "All of Us" البحثي، باستخدام إطار عمل موحد من نوع "الكل للكل" لتحديد ما يقرب من 50,000 ارتباط جيني عبر آلاف السمات، ومن خلال التحليل التلوي مع بنك البيانات الحيوي البريطاني (UK Biobank)، الكشف عن روابط جديدة بين الجينات والأنماط الظاهرية مع توفير أدوات عامة للبحث العالمي.
تُظهر هذه الدراسة أن طول تكرار CAG في بروتين الهنتنغتين يعمل كمعدِّل كمي مستمر لبنية الدماغ والهشاشة النفسية العصبية عبر عموم السكان، مما يتحدى الرؤية التقليدية له باعتباره محدداً فئوياً بحتاً لمرض هنتنغتون.
تقدم هذه الدراسة خريطة شاملة لإمكانية وصول الكروماتين على مستوى الخلية الواحدة لـ 3.5 مليون خلية مناعية بشرية من أكثر من 1,000 متبرع، كاشفةً أن دمج سمات الـ caQTL الخاصة بنوع الخلية مع البيانات متعددة الأوميكس يعزز بشكل كبير من تحديد الآليات التنظيمية والشبكات الجينية المرتبطة بالأمراض مقارنة بالنهج التقليدية.
تقدم هذه الدراسة إطار عمل حوسبي يدمج بين تعلم الآلة، وتحليل شبكة التفاعل بين البروتينات، والتحقق من النسخ الوراثي لتحديد ستة بروتينات واعدة كعلامات حيوية (OSM، IL6R، LMNB1، HIF1A، NPM1، وCSF1) للتشخيص المبكر، والتنبؤ بالمسار المرضي، والاكتشاف العلاجي لمرض CLN3.
تستفيد هذه الدراسة من مجموعة بيانات ضخمة متعددة الأصول من قدامى المحاربين الأمريكيين من برنامج "مليون محارب قديم" في تحليل تلوّي مع بيانات موجودة لتحديد 26 موقعاً جديداً ذا دلالة على مستوى الجينوم مرتبطة بمرض ألزهايمر والخرف، مما يوسع نطاق الاكتشاف الجيني إلى ما وراء منطقة APOE ويعزز تمثيل مجموعات الأصول غير الممثلة كفاية.
تحدد هذه الدراسة مواقع جينية جديدة مرتبطة باعتلال عضلة القلب الضخامي، وتثبت أن درجة المخاطر متعددة الجينات التي تم تطويرها حديثاً تتنبأ بفعالية بتشخيص اعتلال عضلة القلب الضخامي، والأنماط الظاهرية التصويرية، والنتائج السريرية الضائرة، لا سيما في الحالات سالبة الساركومير.